首頁(yè) > 組學(xué)測(cè)序 > 基因組 > T2T基因組
T2T(Telomere-to-Telomere)基因組代表著從染色體的一個(gè)端粒到另一個(gè)端粒的完整基因組序列。端粒是染色體末端的一種特殊結(jié)構(gòu),在細(xì)胞分裂過(guò)程中起到保護(hù)染色體完整性的作用。以往的基因組測(cè)序往往存在一些間隙(gaps),無(wú)法完整覆蓋整個(gè)染色體序列,而T2T基因組的目標(biāo)是實(shí)現(xiàn)無(wú)間隙的全基因組序列。
PacBio和Nanopore長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用,解決復(fù)雜基因組區(qū)域難題,T2T基因組組裝需要專門的高精度組裝算法。這些算法在處理長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序數(shù)據(jù)時(shí),能夠有效地識(shí)別和糾正測(cè)序錯(cuò)誤,同時(shí)準(zhǔn)確地拼接讀長(zhǎng)。除了長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序數(shù)據(jù)外,T2T基因組組裝還會(huì)結(jié)合其他類型的數(shù)據(jù),如光學(xué)圖譜數(shù)據(jù)和Hi-C(染色體構(gòu)象捕獲)數(shù)據(jù)。光學(xué)圖譜可以提供染色體的物理圖譜信息,幫助確定基因組的宏觀結(jié)構(gòu);Hi-C數(shù)據(jù)則可以揭示染色體在細(xì)胞核內(nèi)的三維空間構(gòu)象,輔助組裝算法確定基因和基因組片段之間的相對(duì)位置,從而進(jìn)一步提高基因組組裝的質(zhì)量。
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