分析目的

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)/毒理學(xué)+分子對(duì)接技術(shù)可以用于探討中藥/化合物，對(duì)疾病/健康的作用機(jī)制。尋找潛在的治療靶點(diǎn)/毒性靶點(diǎn)。構(gòu)建分子-靶標(biāo)結(jié)合位點(diǎn)，為理解成分在疾病中的作用提供分子層面的見解。

數(shù)據(jù)來源

ChEMBL、DrugBank、TOXNET、CTD、OMIM、KEGG等公共數(shù)據(jù)庫。

分析方法

利用中醫(yī)藥系統(tǒng)藥理學(xué)（TCMSP）數(shù)據(jù)庫、疾病基因數(shù)據(jù)庫（Genecards、OMIM、PharmGkb、DrugBank、TTD）、建立靶點(diǎn)與疾病相關(guān)基因集。使用Cytoscape 軟件構(gòu)建了“成分-靶標(biāo)”交互式主動(dòng)網(wǎng)絡(luò)圖譜?；跇屑~基因進(jìn)行功能富集分析。利用STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)。使用SwissADME工具評(píng)估士的寧的藥代動(dòng)力學(xué)（ADMET）特性。使用Autodock Vina進(jìn)行分子對(duì)接，以探索化合物與靶蛋白之間的相互作用。最后，運(yùn)用分子對(duì)接技術(shù)評(píng)估化合物與核心靶標(biāo)的結(jié)合能力。

分析內(nèi)容

獲得相關(guān)成相關(guān)基因的基因集，分析與相關(guān)的潛在靶點(diǎn)、構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)篩選核心目標(biāo)、GO 和KEGG 通路富集分析、分子對(duì)接。

分析結(jié)果示例圖