全長微生物多樣性測序是一種基于三代PacBio測序平臺的高通量測序技術,它利用單分子實時測序(SMRT Cell)的方法對微生物的標記基因(如細菌的16S rRNA基因、真菌的ITS區(qū)域)進行全長測序。這種技術能夠提供更全面的微生物群落結構信息,包括物種組成、基因功能和代謝通路等,從而更真實地還原樣本中的微生物群落結構。
產(chǎn)品特點
1、覆蓋度廣、讀長長、通量高、物種注釋準確:Pacbio全長微生物多樣性測序技術結合了一代Sanger測序的讀長優(yōu)勢和Illumina測序的高通量優(yōu)勢,能夠?qū)⒓毦?6S全長和真菌ITS全長完全測通,在細菌、真菌群落結構分析中具有顯著優(yōu)勢。
2、超高準確性:PacBio測序平臺CCS模式,minPasses≥5,能夠提供超高準確性的測序結果。
3、種水平注釋:承諾注釋到“種”水平,種水平注釋平均注釋率≥60%,告別挑選測序引物的糾結時代,開啟種水平鑒定“新紀元”。
4、全長序列信息:全長序列中攜帶的特征信息更多,支持“種”水平的分辨率,避免了短讀長擴增子的PCR引物選擇會影響推斷的群落準確性和某些細菌類群的敏感性。
5、CCS擴增子測序模式:結合DADA2軟件算法,可獲得單堿基/近零錯誤率的全長rRNA基因序列。
6、更高的數(shù)據(jù)質(zhì)量:PacBio CCS自我矯正模式可獲得高質(zhì)量的數(shù)據(jù)。
7、更高的比對率:注釋到各分類水平的序列比對率更高。
8、更高的分辨率:16S全長序列分析到種分類水平。
結果展示
1.動物組織>0.3g,核酸不豐富部位,例如脂肪、成熟皮膚、骨頭等部位建議增加送樣量。
2.動物血液(哺乳類)>1mL;動物血液(紅細胞有核類)> 0.5mL,血清血漿需酌情增加送樣量。
3.唾液>4mL。
4.菌液(對數(shù)生長期)>4mL;菌體:對應菌液離心后菌沉淀30-50μL;真菌菌絲>0.5g。
5.土壤:固體2g,液體2mL。
6.糞便、腸道內(nèi)容物、食糜≥1mL(離心管刻度);瘤胃液>2mL,胃液有渾濁,離心送沉淀為佳。
7.水體(濾膜):直徑4cm,濾膜3張,如果菌群豐度較低,建議增加送樣量。
8.拭子>4個,拭子表面有明顯顏色變化,達到富集微生物的目的。
科研服務咨詢
公眾號二維碼